2012 मध्ये, तत्कालीन मुख्यमंत्री मनोहर पर्रीकर यांनी फुटबॉलला राष्ट्रीय खेळ म्हणून घोषित केले, तेव्हा भारतातील इतर राज्यासाठी हा नवीन खेळ होता, तेव्हा सर्वांनी या निर्णयाचे कौतुक केले. पण प्रत्यक्षात, सरकारला फुटबॉलचा गोव्यातील प्रभाव लक्षात यायला इतका वेळ लागला नसावा. 1883 मध्ये ब्रिटीश धर्मगुरू फादर विल्यम रॉबर्ट लायन्स यांनी प्रथम हा खेळ गोव्यात आणला तेव्हापासून फुटबॉल हा केवळ एक खेळ न राहता गोव्याची ओळख बनला आहे.

गोवा फुटबॉल असोसिएशन ची स्थापना 1959 मध्ये झाली. फेडरेशनने 1959 मध्ये गोवा फर्स्ट डिव्हिजन या नावाने पहिली गोवा राज्य लीग आयोजित केली आणि क्लब इंडिपेंडेंट डी मारगाव चॅम्पियन बनला. त्यानंतर GFA ने 1969 मध्ये गोवा सीनियर लीग सुरू केली. त्यानंतर 1970-71 च्या सामन्यांसाठी लीगचे दोन विभाग करण्यात आले, उत्तर विभाग आणि दक्षिण विभाग असे रूपांतरित केले. त्यानंतर 1971-72 मध्ये द्वितीय विभाग आणि तृतीय विभाग सुरू केला.

त्यानंतर GFA ने 1977 मध्ये गोवा सुपर डिव्हिजन सुरू केले आणि साळगावकर S.C चॅम्पियन बनले. हा खेळ जागतिक स्तरावर, वेगाने विकसित होत राहिल्याने, गोवा (goa) फुटबॉल असोसिएशनने निर्णय घेतला की खेळाला उच्च व्यासपीठावर पाठवण्याची वेळ आली आहे. गोवा हे भारतातील पहिले राज्य म्हणून पुढे आले जे व्यावसायिक फुटबॉल (Football) खेळते. त्यानंतर GFA ने 1997 मध्ये गोवा प्रोफेशनल लीगची स्थापना करून नॅशनल स्टेट लीगमध्ये सुधारणा केली आणि साळगावकर चॅम्पियन म्हणून पुढे आले. 2000-01 सीझनपासून प्रोफेशनल लीगचा विस्तार सहा संघांमध्ये करण्यात आला.

मनोहर पर्रीकर (Manohar Parrikar) यांनी फुटबॉलसाठी अर्थसंकल्पात तरतूद केल्यानंतर तरतुदींतर्गत प्रत्येक राज्याच्या अर्थसंकल्पात खेळांसाठी मोठ्या प्रमाणात तरतूद करण्यात आली. 2019-20 च्या अर्थसंकल्पात वितरण 314 कोटी रुपये होते. वाढीव अर्थसंकल्पीय तरतुदीसह GFDC लाँच केले. पर्रिकर यांनी मार्च 2012 मध्ये सत्तेवर आल्यानंतर अर्थसंकल्प सादर केला तेव्हा फुटबॉल समुदायाने त्यांचे स्वागत केले. त्या अर्थसंकल्पीय (Budget) अधिवेशनात त्यांनी फुटबॉल हा गोव्याचा अधिकृत खेळ असल्याची घोषणा केली. त्यांनी जीएफडीसीच्या अध्यक्षपदी रुफिनो मॉन्टेरो यांच्या नावाची घोषणा केली. जीएफडीसीला काही महिन्यांतच त्याची जागा मिळाली, ज्याचे उद्घाटन पर्रीकर यांनी त्याच वर्षी जुलैमध्ये पट्टो-पणजी येथे केले. गोवा फुटबॉल असोसिएशन (GFA), अखिल भारतीय फुटबॉल महासंघ (AIFF), आशियाई फुटबॉल महासंघ (AFC) आणि फेडरेशन इंटरनॅशनल डी फुटबॉल असोसिएशन (FIFA) यांच्या प्रयत्नांना पूरक म्हणून GFDC ही स्वतंत्र संस्था म्हणून स्थापन करण्यात आली.